VmWare ile ilgili bilgim yok. Ancak size Pardus 2011 kurulumu ile ilgili bazı genel noktaları açıklayabilirim.

İlk olarak, kurulum seçeneklerinden "Diskin tamamını kullan" seçeneğini seçmeniz durumunda Pardus, diskin 500 MB kadar bir bölümünü açılış (boot) kısmı için ayıracak ve geri kalan kısmı mantıksal sürücü olarak biçimlendirecektir. İleride bu bölümü yeniden boyutlandırmak ve bölmek ihtiyacı duyarsanız, mantıksal sürücüyü bölmek ve boyutlandırmak, aynı işlemi fiziksel sürücüye yapmaktan daha az risk taşır. Eğer tek bir disk bölümü üzerine Pardus kurmak istiyorsanız, "Kendi düzenini yarat" diyerek, disk alanının tamamını kullananek bir standart fiziksel bölüm oluşturarak oraya kurun.
İkinci olarak, bildiğim VBox sanal makine için evet, biçimlendirme işlemi yapılır. Ama biçimlendirme sabit diskinize değil, sanal makinenin kullandığı disk imaj dosyasına yapılır.
Pardus kurulumunu daha önce oluşturmuş olduğunuz bir VmWare disk imaj dosyası üzerine mi yapmaya çalışıyorsunuz?

İlk kez özgür yazılım dünyasına girmek çok zevklidir. Ama alışma döneminde sorunlar çıkabilir. İlk olarak, WMware GNU/Linux dünyasına yaklaşmaya çalışıyor. Fakat uyum süreci daha bitmiş durumda değil. Ben de ilk Ubuntu dağıtımını WMware'de kurmuştum. Benzer sorunları yaşamıştım. Windows Xp'nin Microsoft desteği bitmiş durumda. Bu yüzden, WMware ya da benzer programların çalışmasında sorun olacaktır. Bir de kurulumu virtualbox'tan deneyip, benzer sorunlar yaşanıyor mu kontrol etmekte fayda var. Öyle yapılmasa bile, WMware sanallaştırma uygulaması'nda, sorunlar programın kendisinden kaynaklanıyor genelde. GNU/Linux dağıtımlarını kurmada ya da öyle bir dağıtımda çalıştırmada sorun çıkabiliyor. Sorun ondan kaynaklanmıyorsa, Windows Xp'den kaynaklanması büyük ihtimal. Umarım GNU/Linux dünyasında istedğini bulursun.

evet virtual box çok daha kolay mesela orda ubuntuyu seçip yükleme yapabilirsin